More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3449 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 271 aa  551  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  67.8 
 
 		 292 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0179  extracellular solute-binding protein family 3  55.46 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.861568 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1168  extracellular solute-binding protein family 3  54.72 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1138  extracellular solute-binding protein family 3  54.72 
 
 		 255 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  46.8 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1276  extracellular solute-binding protein  36.98 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  29.63 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  29.45 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 		 278 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.2 
 
 		 286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.2 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  30.93 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  25.38 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.11 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.72 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  31.03 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.87 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  27.84 
 
 		 273 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.6 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.97 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.6 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.53 
 
 		 288 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  30.6 
 
 		 288 aa  97.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  27.63 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.04 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.08 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  32.59 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.47 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  32.59 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  27.16 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  26.97 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  26.39 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.2 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  27.41 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  30.25 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  25.64 
 
 		 294 aa  90.5  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  24.34 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 279 aa  88.6  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  24.12 
 
 		 323 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  28.63 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.92 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.92 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  27.05 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 284 aa  87  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  24.79 
 
 		 324 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  26.57 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  33.83 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  26.57 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14100  putative amino acid-binding protein  27.12 
 
 		 341 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.111954  normal  0.0628834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 292 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  23.45 
 
 		 296 aa  85.5  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  27.04 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  22.76 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>