More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2669 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 287 aa  579  1e-164  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  60.98 
 
 		 284 aa  341  8e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  59.21 
 
 		 285 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  63.71 
 
 		 300 aa  332  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  57.6 
 
 		 288 aa  331  7.000000000000001e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  58.03 
 
 		 297 aa  328  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  61.42 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1064  surface antigen, CjaA  52.8 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0806  CjaA protein  52.8 
 
 		 279 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.834  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1001  CjaA protein  52.45 
 
 		 279 aa  299  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  53.24 
 
 		 275 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  46.85 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  43.71 
 
 		 286 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.19 
 
 		 281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  43.36 
 
 		 286 aa  241  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  44.06 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3082  glutamine/glutamate ABC transporter, periplasmic glutamine/glutamate-binding protein  41.11 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.171544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2941  extracellular solute-binding protein  43.11 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0228  extracellular solute-binding protein  41.38 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1245  amino acid  37.25 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  31.56 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  36.97 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0813  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  34.03 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.000000000481343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.59 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.22 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.22 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 		 276 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.38 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.96 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 292 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 266 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  33.63 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.07 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  32.94 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  29.78 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  35.41 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3092  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.559619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.76 
 
 		 283 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  30.15 
 
 		 268 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  32.84 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  34.36 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  34.36 
 
 		 295 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5536  extracellular solute-binding protein family 3  27.91 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.901177  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  32.57 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.44 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  32.86 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.75 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.75 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  35.75 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 267 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.68 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5258  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.677856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4546  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3951  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.43 
 
 		 280 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0965  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000439884  n/a   
 
 
 
NC_011365  Gdia_0925  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.796106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  29.3 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  32.88 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 294 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>