More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6211 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6211  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6380  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6613  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0305717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0691  extracellular solute-binding protein  62.21 
 
 		 277 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0925  extracellular solute-binding protein family 3  39.57 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.796106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  32.44 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.21 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1025  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  29.85 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  32.54 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.43 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.14 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  27.84 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0448  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.917749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  29.48 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 297 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0161  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.445955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.15 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1539  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.24 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.363793  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0094  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.33 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.546217  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.93 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.54 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  29.24 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.36 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4065  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0712099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2669  extracellular solute-binding protein  30 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00514827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3673  extracellular solute-binding protein family 3  28.06 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1029  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000261026  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  31.46 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30.51 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.79 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0438  antigenic protein  26.02 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.657093  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0449  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1742  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 323 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.25 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.25 
 
 		 243 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0290  acriflavine resistance protein  29.44 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.25 
 
 		 288 aa  95.5  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0664  surface antigen, CjaA  29.26 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0251747  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  26.98 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3472  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3989  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.128732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  26.72 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0298  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0891  extracellular solute-binding protein family 3  26.29 
 
 		 267 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  26.72 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.38 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.17 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3130  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 281 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  28.77 
 
 		 288 aa  92  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.84 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  27.13 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  28.89 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5245  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.62 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>