More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1935 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 288 aa  586  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  67.48 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  48.53 
 
 		 276 aa  263  4e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  49.65 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  50.2 
 
 		 277 aa  248  8e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  42.22 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.24 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  41.24 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  41.24 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  41.24 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.85 
 
 		 276 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.85 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.88 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  40.88 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  40.43 
 
 		 281 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  41.11 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  43.1 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  35.24 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  31.51 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 		 271 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.17 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 		 315 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 		 295 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.22 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  33.61 
 
 		 323 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2423  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 		 343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0450755  normal  0.051876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1539  extracellular solute-binding protein family 3  29 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3163  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 246 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  34.29 
 
 		 294 aa  112  9e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  31.74 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 		 305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  30.5 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.34 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1172  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  35.44 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5218  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  31.08 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3379  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0252504  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6249  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  28.27 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.73 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  29.57 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.14 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.59 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  32.59 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5946  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  30.38 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5607  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5971  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480702  normal  0.0122202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6471  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.0842287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  29.64 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.91 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0693  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding lipoprotein  26.52 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.35 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4441  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  29.25 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4503  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 299 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.101015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  30.33 
 
 		 296 aa  99  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  29.1 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  30.9 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3449  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 271 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4307  family 1 extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  27.89 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  29.24 
 
 		 273 aa  97.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  30.88 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.19 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.15 
 
 		 251 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>