More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0771 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  66.29 
 
 		 264 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  53.41 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  49.24 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  52.28 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  44.87 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.92 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.55 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  47.17 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  46.79 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.91 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  44.91 
 
 		 248 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  45.08 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 		 513 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  46.46 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  45.28 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  45.54 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.4 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  48.46 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  48.46 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  45.37 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  44.03 
 
 		 501 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  42.86 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.23 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.23 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.23 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.83 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.83 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  44.2 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.83 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.83 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.75 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.3 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 260 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.75 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.75 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.75 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  40.98 
 
 		 272 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  41.96 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  38.38 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  43.24 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  43.18 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  37.93 
 
 		 260 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.87 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 246 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  42.79 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 		 281 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  38.82 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.78 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  40.37 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  37.55 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.55 
 
 		 492 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  38.15 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.84 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 		 493 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  39.45 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  37 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.96 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  36.29 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  38.21 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.23 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  36.51 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  39.72 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  40.28 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  40.28 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  36.11 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  34.59 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  36.92 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  39.19 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 244 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  37 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.43 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  35.86 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  33.85 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.08 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  33.85 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  34.02 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>