More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1868 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  53.92 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  42.39 
 
 		 245 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  45.38 
 
 		 245 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  43.51 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  44.34 
 
 		 246 aa  187  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.78 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  45.78 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  45.33 
 
 		 244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  41.13 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  45.33 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  44.89 
 
 		 244 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  43.72 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  38.28 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  38.75 
 
 		 247 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  41.95 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  40.18 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.19 
 
 		 490 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  38.15 
 
 		 264 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  41.06 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  41.06 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  40.28 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  39.92 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.86 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  34.38 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  42.4 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.34 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.34 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.08 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.67 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  37.5 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  37.95 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  34.39 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.99 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.18 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.36 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 		 284 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.13 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  35.8 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  32.38 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.39 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  36.71 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.44 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  34.3 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  37.44 
 
 		 254 aa  141  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.77 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.77 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.47 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.77 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  35.95 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.38 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.38 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.38 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.61 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  34.38 
 
 		 259 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.77 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.61 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.61 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.61 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  34.84 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.98 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.65 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  34.92 
 
 		 283 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  34.6 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>