More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0434 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  62.2 
 
 
242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  59.39 
 
 
255 aa  268  5.9999999999999995e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  51.94 
 
 
256 aa  257  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  52.63 
 
 
238 aa  251  5.000000000000001e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  53.18 
 
 
241 aa  239  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  54.84 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  44.27 
 
 
251 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  47.49 
 
 
251 aa  208  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  47.03 
 
 
251 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  42.27 
 
 
259 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 
250 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 
245 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  35.46 
 
 
247 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.54 
 
 
244 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 
245 aa  154  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  41.89 
 
 
242 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
244 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
244 aa  152  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
244 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  35.95 
 
 
247 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  36.7 
 
 
247 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 
244 aa  150  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  39.82 
 
 
250 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  34.48 
 
 
260 aa  138  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.81 
 
 
490 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.73 
 
 
247 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  36.74 
 
 
485 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  39.37 
 
 
257 aa  135  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  34.96 
 
 
268 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 
485 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 
485 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
260 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
299 aa  132  5e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  34.24 
 
 
271 aa  132  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  32.17 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 
268 aa  131  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.56 
 
 
259 aa  131  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.48 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.56 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.95 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 
247 aa  129  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.27 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  34.42 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 
282 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.42 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.98 
 
 
243 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.94 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  35 
 
 
265 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.94 
 
 
243 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.94 
 
 
243 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.94 
 
 
243 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.94 
 
 
243 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  35.94 
 
 
243 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  34.84 
 
 
266 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  34.84 
 
 
266 aa  125  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  34.84 
 
 
266 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.79 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.79 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 
281 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.79 
 
 
250 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.07 
 
 
243 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
260 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.11 
 
 
243 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.11 
 
 
245 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.11 
 
 
245 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.43 
 
 
243 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.69 
 
 
265 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.11 
 
 
243 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.11 
 
 
243 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  34.07 
 
 
243 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.07 
 
 
243 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.38 
 
 
250 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.38 
 
 
250 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>