More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1566 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
253 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  47.06 
 
 
260 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  50.23 
 
 
254 aa  223  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  39.36 
 
 
247 aa  174  8e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  41.74 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
246 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
244 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
244 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
242 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
244 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  39.9 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
244 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.5 
 
 
244 aa  136  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  40.19 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
260 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
245 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.03 
 
 
490 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  30.49 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  32.1 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  30.49 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 
277 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  32.27 
 
 
257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.23 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  30.08 
 
 
251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.05 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.66 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.05 
 
 
264 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 
264 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  34.25 
 
 
259 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.66 
 
 
264 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  31.66 
 
 
264 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.66 
 
 
264 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  31.66 
 
 
264 aa  112  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  30.99 
 
 
247 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  27.27 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.98 
 
 
264 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  28.57 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 
264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 
271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.53 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.59 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
251 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 
264 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
282 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 
264 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 
264 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
243 aa  106  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  32.38 
 
 
249 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  32.29 
 
 
249 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
284 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0714  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 
755 aa  105  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  29.71 
 
 
242 aa  105  9e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  32.32 
 
 
260 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.05 
 
 
250 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  27.73 
 
 
255 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.58 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.58 
 
 
250 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.58 
 
 
250 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  32.04 
 
 
238 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  29.65 
 
 
252 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 
254 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
485 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 
254 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  32.23 
 
 
241 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.91 
 
 
485 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.71 
 
 
251 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.1 
 
 
250 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.1 
 
 
250 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
264 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.1 
 
 
250 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
239 aa  102  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 
244 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.86 
 
 
248 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.18 
 
 
265 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  31.23 
 
 
249 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.23 
 
 
268 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  27.8 
 
 
266 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
254 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.7 
 
 
278 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  26.59 
 
 
252 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
279 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 
258 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.62 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.38 
 
 
248 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.62 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 
283 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.62 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.62 
 
 
250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.16 
 
 
248 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  31.27 
 
 
247 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>