More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1571 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
249 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  70.4 
 
 
249 aa  361  6e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  64.92 
 
 
251 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  63.44 
 
 
247 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  57.72 
 
 
247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  56.28 
 
 
252 aa  279  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  46.43 
 
 
257 aa  224  8e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  48.87 
 
 
276 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  47.75 
 
 
272 aa  201  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  41.18 
 
 
263 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  42.99 
 
 
294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
258 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  36.92 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  38.6 
 
 
264 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  38.16 
 
 
264 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
246 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  37.72 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 
246 aa  135  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.57 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.08 
 
 
251 aa  135  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  34.69 
 
 
246 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  34.73 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.84 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  34.8 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  34.8 
 
 
285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.8 
 
 
266 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  34.4 
 
 
266 aa  132  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  34.8 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  35.2 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  34.52 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  34.52 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  35.97 
 
 
258 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  37.13 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  35.52 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  32.66 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  33.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.69 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.97 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  33.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  33.73 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
250 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  36.7 
 
 
265 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.7 
 
 
256 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.78 
 
 
254 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.07 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
258 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 
246 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  32.68 
 
 
264 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.68 
 
 
264 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 
248 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
277 aa  122  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2251  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 
263 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
250 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.28 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  31.69 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  34.54 
 
 
264 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  33.49 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  36.27 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2163  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.38 
 
 
258 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0442479  decreased coverage  0.0000000159985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  32.89 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  32.89 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  34.68 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 
264 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 
247 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  35.25 
 
 
258 aa  118  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 
264 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
250 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.66 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1248  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.91 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.29 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1090  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  33.91 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0747  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.91 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  34.41 
 
 
259 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1095  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  33.91 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1579  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  33.91 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0988  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  33.91 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.310906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  31.63 
 
 
265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  34.29 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3018  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  33.91 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.280802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 
260 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5842  extracellular solute-binding protein family 3  32.5 
 
 
261 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 
245 aa  115  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  32.03 
 
 
285 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  33.07 
 
 
263 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.14 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>