More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2054 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 258 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  46.31 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  37.7 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  38.25 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  38.57 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  36.95 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  35.43 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  35.4 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 		 243 aa  138  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  34.8 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 285 aa  123  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  32.64 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  31.09 
 
 		 248 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.27 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  30.25 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.62 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.96 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  30.3 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.94 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  30.74 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  30.74 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.95 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  26.72 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  28.29 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  28.87 
 
 		 736 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1302  histidine kinase  30.27 
 
 		 596 aa  99.4  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000333005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.79 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  26.91 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  30.83 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.2 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  30.17 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  27.31 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.38 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  28.4 
 
 		 727 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.13 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.94 
 
 		 264 aa  95.5  8e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 265 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 282 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.96 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.17 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.18 
 
 		 493 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  30.14 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  28.11 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.85 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.39 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.59 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  30 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 261 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.83 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4942  amino acid ABC transporter permease  28.34 
 
 		 489 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6600  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.34 
 
 		 489 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.34 
 
 		 489 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.83 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.02 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.22 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  28.23 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.2 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 		 503 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>