More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1664 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  46.26 
 
 		 276 aa  258  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  48.4 
 
 		 272 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  42.01 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  50.2 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  45.29 
 
 		 249 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  43.3 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  43.95 
 
 		 249 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  40.81 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  40.09 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  38.77 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  38.36 
 
 		 244 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.78 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  34.39 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 		 246 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.39 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  27.49 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.79 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 		 247 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  34.51 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  34.07 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.9 
 
 		 513 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  30.66 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 244 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  31.39 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  26.88 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 283 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.23 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 295 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  29.97 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.62 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  32.14 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 244 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.55 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.27 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  30.97 
 
 		 256 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 247 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 244 aa  99.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.53 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  29.76 
 
 		 271 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 		 265 aa  99.4  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.91 
 
 		 257 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.91 
 
 		 257 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  29.57 
 
 		 256 aa  99  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  29.15 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  31.75 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.6 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003972  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.38 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.02 
 
 		 266 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 		 250 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.68 
 
 		 490 aa  96.3  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.9 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.53 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.22 
 
 		 243 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.15 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  31.75 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0295  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  28.02 
 
 		 266 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.874401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  30.47 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>