More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0131 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  100 
 
 
285 aa  565  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  77.09 
 
 
283 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  72.53 
 
 
285 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  71.43 
 
 
286 aa  354  7.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  51.3 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
255 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  50.66 
 
 
256 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  47.7 
 
 
256 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  48.47 
 
 
261 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  48.46 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  47.14 
 
 
273 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  38.26 
 
 
263 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  41.98 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  44.3 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  43.58 
 
 
260 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.75 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  40.91 
 
 
251 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  42.99 
 
 
250 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  41.56 
 
 
246 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  42.47 
 
 
248 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 
257 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 
260 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  42.47 
 
 
248 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  35.48 
 
 
269 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  36.88 
 
 
271 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  39.74 
 
 
501 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  39.33 
 
 
268 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
264 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  37.92 
 
 
246 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  37 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.62 
 
 
513 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  39.91 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
276 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  39.82 
 
 
271 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  38.77 
 
 
244 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  34.36 
 
 
265 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  34.18 
 
 
272 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
246 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  34.78 
 
 
736 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  39.73 
 
 
281 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
264 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
254 aa  138  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  37.89 
 
 
265 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  34.62 
 
 
247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
265 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
262 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.71 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  34.89 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.42 
 
 
250 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  40.53 
 
 
282 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  35 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.76 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.76 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  36.28 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  36.17 
 
 
244 aa  132  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.72 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  36.77 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  32.18 
 
 
272 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.44 
 
 
248 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  35 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.03 
 
 
492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
250 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  34.22 
 
 
266 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  32.89 
 
 
727 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  35.77 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  33.72 
 
 
260 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  33.8 
 
 
287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.68 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.35 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.21 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.11 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.21 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.43 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
243 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.21 
 
 
250 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.36 
 
 
264 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 
248 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
264 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
266 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>