More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0032 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 276 aa  564  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  54.32 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  51.3 
 
 		 272 aa  273  3e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  46.26 
 
 		 294 aa  255  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3903  extracellular solute-binding protein  49.12 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.754855  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  47.16 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  47.41 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  48.4 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  47.96 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0805  extracellular solute-binding protein family 3  46.54 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2054  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 258 aa  191  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.179486 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  44.59 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  39.29 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  40.45 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  34.65 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  37.67 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  37.67 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.73 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1958  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter  33.89 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.488249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  34.65 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  36.24 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1454  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.56 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.72 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  35.81 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.32 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  38.3 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.73 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.63 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  34.93 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.19 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  34.45 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.71 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 		 513 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  32.74 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  36.64 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1928  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 265 aa  122  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.18 
 
 		 260 aa  122  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.64 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3355  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  36.87 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.91 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  32.3 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.36 
 
 		 266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  32.2 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.22 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 261 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3512  extracellular solute-binding protein family 3  32.6 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  35.44 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.84 
 
 		 266 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 258 aa  118  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.77 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  29.63 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2323  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  33.61 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  31.28 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  30.94 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2833  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  30.13 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2179  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.158318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.74 
 
 		 250 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.51 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  33.04 
 
 		 727 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  31.9 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01550  hypothetical protein  32.22 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  34.51 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1240  amino acid binding protein  33.77 
 
 		 263 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4292  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  32.91 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  29.15 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0325  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.09 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.38 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 265 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.33 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>