More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5539 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 268 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  74.63 
 
 		 267 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  69.4 
 
 		 265 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  74.25 
 
 		 266 aa  384  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  74.25 
 
 		 295 aa  384  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  71.76 
 
 		 265 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  64.81 
 
 		 262 aa  345  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  55.84 
 
 		 274 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  44.12 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  45.82 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  48 
 
 		 257 aa  228  6e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  51.59 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  40.89 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  44.83 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  46.35 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  46.22 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  45.78 
 
 		 264 aa  205  8e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  46.02 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  44.1 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  40.38 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  40.89 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.34 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.82 
 
 		 283 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  35.29 
 
 		 283 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.21 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  33.33 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.36 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.32 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  37.44 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  34 
 
 		 276 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.21 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  34.21 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  34.21 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  34.21 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  34.21 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.77 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  33.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.74 
 
 		 265 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  32.22 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37.39 
 
 		 257 aa  132  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  31.97 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  33.33 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 264 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  32.46 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  35.52 
 
 		 283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.73 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.49 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  35.37 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.05 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.65 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.57 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.29 
 
 		 264 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.16 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 260 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06880  amino acid-binding protein  31.78 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0612376  normal  0.365115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.26 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.7 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  35.29 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  35.29 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1458  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000125438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.08 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.47 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  32.6 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  31.03 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1067  extracellular solute-binding protein family 3  30.29 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0464798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.21 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.21 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>