More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_13330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  100 
 
 		 291 aa  597  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  65.54 
 
 		 276 aa  339  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06880  amino acid-binding protein  61.45 
 
 		 286 aa  288  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0612376  normal  0.365115 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03950  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  49.8 
 
 		 364 aa  242  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.72321  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  40.14 
 
 		 284 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  38.18 
 
 		 262 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.53 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  32.72 
 
 		 274 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  35.27 
 
 		 265 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  32.41 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.91 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.91 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  30.32 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  31.18 
 
 		 263 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.56 
 
 		 276 aa  132  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  29.35 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 283 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.88 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.74 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.74 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  30.89 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  29.74 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1458  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000125438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.1 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  30.07 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  30.17 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  25.37 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  26.55 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 		 248 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.18 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  29.18 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 250 aa  99.4  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  28.94 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  27.39 
 
 		 265 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.21 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  27.27 
 
 		 263 aa  95.5  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.21 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.7 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2548  extracellular solute-binding protein  29.15 
 
 		 249 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163495  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.61 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.21 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.61 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.61 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.21 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.7 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.2 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.26 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  30.31 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.84 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.94 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.12 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.35 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.35 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.35 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 268 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.31 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  28.62 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.28 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  25.68 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  27.97 
 
 		 250 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2092  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  25.65 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.514591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  26.47 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  25.64 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  28.67 
 
 		 281 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 		 271 aa  86.3  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 260 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  30.64 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 284 aa  85.5  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  26.09 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>