More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2092 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2092  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.514591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  30.42 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2091  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  29.03 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237181  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
265 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
264 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  29.61 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.29 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.36 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.36 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
255 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
295 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
266 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
268 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 
262 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  24.34 
 
 
274 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  28.73 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.03 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.03 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.03 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  28.03 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.15 
 
 
265 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.73 
 
 
265 aa  99  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.73 
 
 
265 aa  99  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  27.43 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03950  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.75 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.72321  normal  0.568441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  26.57 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
270 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.62 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.32 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.38 
 
 
262 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.74 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
266 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.21 
 
 
263 aa  92  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06880  amino acid-binding protein  27.94 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0612376  normal  0.365115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.03 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  25.65 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  26.47 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
283 aa  86.3  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  28.39 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  24.9 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4038  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
252 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  24.47 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  25.11 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0690  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370968  normal  0.982005 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.4 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  27.18 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.79 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.58 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  23.68 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  25.76 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  24.82 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  24.13 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  23.21 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.18 
 
 
264 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  24.54 
 
 
502 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  24.54 
 
 
502 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>