More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0366 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  77.56 
 
 		 254 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  76.38 
 
 		 254 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 253 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  33.78 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  29.69 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.89 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  29.53 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  27.09 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.23 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.85 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.84 
 
 		 513 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.85 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.86 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.86 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.73 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.76 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 270 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.28 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  26.1 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  26.88 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 248 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  27.2 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  30.36 
 
 		 286 aa  93.2  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 294 aa  92.4  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  25.4 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0296  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5576  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 503 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.56 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 		 284 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.4 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  25.9 
 
 		 502 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  25.9 
 
 		 502 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.1 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 270 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  28.96 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 266 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  28.02 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.29 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.2 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>