More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0820 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
252 aa  507  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  68.15 
 
 
252 aa  351  7e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  68.15 
 
 
252 aa  348  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  66.53 
 
 
252 aa  346  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  39.02 
 
 
253 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
254 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
253 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  35.77 
 
 
254 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
252 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  36.99 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  38.07 
 
 
248 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
239 aa  132  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  34.55 
 
 
248 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
243 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
270 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  34.72 
 
 
260 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.56 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
260 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  30.45 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
260 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.28 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  31.28 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.81 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  30.81 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.81 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  30.81 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.51 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  28.51 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  28.51 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
295 aa  89  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.69 
 
 
260 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  28 
 
 
266 aa  88.6  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  26.67 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.56 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.18 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  28.45 
 
 
273 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  26.64 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2686  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2527  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3156  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0760439 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3140  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
260 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  27.73 
 
 
264 aa  85.9  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.78 
 
 
285 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
266 aa  85.9  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.6 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.6 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.6 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.71 
 
 
264 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.6 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.6 
 
 
243 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.67 
 
 
266 aa  85.5  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
266 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.22 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.22 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.22 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.22 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.67 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2702  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297133  normal  0.511095 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.78 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  28.12 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.51 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.2 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  27.2 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2705  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.75 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.588251  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  26.64 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.64 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1512  hypothetical protein  29.6 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  26.64 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  28.77 
 
 
243 aa  82  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.64 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>