More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0143 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  79.37 
 
 
251 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  65.74 
 
 
253 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  61.66 
 
 
252 aa  315  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 
253 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 
243 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 
247 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  38.28 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
248 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 
253 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 
252 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 
239 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  40.09 
 
 
252 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 
254 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  35.37 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  37.33 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.84 
 
 
257 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 
260 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
248 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
248 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 
260 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  28.97 
 
 
502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.97 
 
 
502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.63 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.8 
 
 
259 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  30.68 
 
 
244 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
270 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.69 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  29.03 
 
 
252 aa  104  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.48 
 
 
259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  26 
 
 
259 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 
250 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.94 
 
 
243 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  28.29 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.29 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  28.29 
 
 
243 aa  101  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.71 
 
 
271 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.82 
 
 
266 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.57 
 
 
263 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.64 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
260 aa  99  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.94 
 
 
243 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.43 
 
 
243 aa  99  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.92 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  26.95 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  26.95 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  26.95 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.45 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.4 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.45 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.67 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.87 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.87 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.87 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.87 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  27.87 
 
 
245 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.96 
 
 
243 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25 
 
 
266 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.55 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.8 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  26.17 
 
 
269 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.81 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.79 
 
 
266 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  32.08 
 
 
238 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.56 
 
 
285 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.8 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.63 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.79 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.56 
 
 
266 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  26.96 
 
 
243 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.56 
 
 
266 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>