More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0013 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  58.5 
 
 		 253 aa  307  9e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  57.37 
 
 		 252 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  48.61 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  47.62 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  43.58 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  43.12 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  40.91 
 
 		 252 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  38 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  37.07 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  37.97 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 246 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  32.73 
 
 		 265 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  31.33 
 
 		 502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  31.33 
 
 		 502 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  30.91 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.64 
 
 		 265 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  29.09 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  29.09 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  29.09 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  29.87 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  29.88 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.64 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.77 
 
 		 266 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.77 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.96 
 
 		 266 aa  101  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  29.02 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4186  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30.77 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  29.3 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.18 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.18 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.18 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.32 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1060  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.703174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0008  putative amino acid ABC transporter,substrate-binding protein  32.26 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00216943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  27.82 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  29.96 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2509  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.18 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000936361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  29.54 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  29.96 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002010  amino acid ABC transporter amino acid-binding portion  32.42 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000538879  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  26.09 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.59 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1513  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  29.15 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00441  ABC amino acid transporter periplasmic component  31.96 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 313 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.19 
 
 		 264 aa  95.1  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 313 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  29.02 
 
 		 313 aa  95.1  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.11 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1538  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.46 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1428  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  27.56 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0353  histidine ABC transporter periplasmic histidine-binding protein  27.56 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.468361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0574  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 		 510 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  27.78 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 277 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  30.77 
 
 		 252 aa  92.8  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 264 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>