More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1775 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  79.37 
 
 		 252 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  66.8 
 
 		 253 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  63.49 
 
 		 252 aa  330  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  48.61 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 247 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  35.47 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  35.78 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  34.02 
 
 		 502 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  34.02 
 
 		 502 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  34.87 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  28.46 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.96 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.17 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.63 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.78 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  27.02 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  28.79 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  28.29 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  26.59 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  31.08 
 
 		 282 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2600  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.35 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.17 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3038  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.1 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  29.02 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.5 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  29.02 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  29.02 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0172  extracellular solute-binding protein family 3  28.06 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00460836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.45 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.87 
 
 		 285 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.87 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.87 
 
 		 266 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.87 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  26.83 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.87 
 
 		 285 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  27.32 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.87 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  27.32 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.31 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.99 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  26.72 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.06 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 283 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.09 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0112  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  26.92 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 247 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.32 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  31.07 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  25.78 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3995  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0932187  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  27.31 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1122  extracellular solute-binding protein family 3  25.57 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  27.62 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.74 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.06 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1920  ABC amino acid transporter extracellular solute-binding protein, family 3  29.1 
 
 		 252 aa  93.6  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.541755  hitchhiker  0.00384825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>