More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1739 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
248 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  83 
 
 
248 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  73.79 
 
 
248 aa  341  7e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1805  extracellular solute-binding protein  52.02 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0545186  unclonable  0.00000000660342 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
252 aa  151  8e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  36.53 
 
 
252 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
252 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
252 aa  135  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
252 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  31.84 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  36.24 
 
 
253 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
253 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 
243 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
247 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
260 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 
257 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
248 aa  92  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  33.71 
 
 
265 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5552  ABC transporter substrate binding protein (glutamine)  31.36 
 
 
250 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.17 
 
 
244 aa  86.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  27.34 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3227  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.355644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  28.74 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3207  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.67 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.98 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  28.41 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1698  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.38 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.176126  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  29.92 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.62 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5882  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
278 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 
270 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  27.16 
 
 
501 aa  82  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1964  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.59 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.822983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0861  extracellular solute-binding protein family 3  27.53 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1471  hypothetical protein  29.96 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0858  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.49 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0229896 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.16 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  25.59 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.78 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6047  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.13 
 
 
598 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166994  normal  0.759317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0036  hypothetical protein  28.19 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0037  hypothetical protein  27.88 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.19 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.27 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25.19 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.19 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  26.15 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  24.41 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0700  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein  26.67 
 
 
243 aa  79  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.347684  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.74 
 
 
260 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
250 aa  79  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.11 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.09 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1512  hypothetical protein  29.52 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.34 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4899  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.092586  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2995  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5371  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.82 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  31.51 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  31.51 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5463  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.14 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  27.9 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2378  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic-binding protein  26.69 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669572  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>