More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1630 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 247 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  83.54 
 
 		 243 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  81.78 
 
 		 248 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  38.19 
 
 		 251 aa  175  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  38.71 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  37.2 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  35.6 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 239 aa  148  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 		 248 aa  125  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  29.03 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  31.98 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 248 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 260 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  29.57 
 
 		 263 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  26.38 
 
 		 502 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  26.59 
 
 		 502 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.17 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  24.8 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 270 aa  88.6  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1122  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 266 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  28.38 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  22.75 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  26.56 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  23.77 
 
 		 736 aa  82.4  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  28.64 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.89 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  24.51 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.98 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.59 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.98 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0179055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.51 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3308  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.944301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2131  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.98 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2793  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  25.83 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.22 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  27.31 
 
 		 990 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  27.31 
 
 		 990 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  23.93 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  27.82 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  21.77 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3136  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0792  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1496  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515934  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0474  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1806  lysine-arginine-ornithine transport system, binding exported protein  25 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0376  putative lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4845  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5438  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  24 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2109  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5424  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.717172  normal  0.449482 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3545  solute-binding family 3 protein  26.03 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  22.66 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  23.93 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  26.64 
 
 		 727 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  25.47 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1792  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  24.03 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.74 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2408  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  0.0134444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>