More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1942 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
277 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  39.92 
 
 
264 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  39.16 
 
 
264 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.28 
 
 
256 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  41.63 
 
 
257 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  37.02 
 
 
263 aa  175  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  45.06 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  37.01 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  41.41 
 
 
255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  44.64 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  36.86 
 
 
274 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  34.96 
 
 
295 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  34.96 
 
 
266 aa  168  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 
265 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  34.83 
 
 
267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  38.82 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  33.82 
 
 
265 aa  163  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  37.17 
 
 
269 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  35.83 
 
 
266 aa  159  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  35.98 
 
 
264 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.36 
 
 
264 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
265 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  32.62 
 
 
286 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
268 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  32.84 
 
 
266 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.98 
 
 
264 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  32.47 
 
 
285 aa  156  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  36.4 
 
 
268 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  32.47 
 
 
285 aa  155  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.23 
 
 
264 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.47 
 
 
266 aa  155  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.04 
 
 
283 aa  155  6e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  40.53 
 
 
264 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.61 
 
 
264 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  35.61 
 
 
264 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  35.61 
 
 
264 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  35.61 
 
 
264 aa  155  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  40.53 
 
 
264 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  36.3 
 
 
262 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  32.1 
 
 
266 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.33 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.33 
 
 
257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  40.53 
 
 
264 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.1 
 
 
266 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  34.17 
 
 
266 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  38.71 
 
 
265 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.85 
 
 
264 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
247 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  34.88 
 
 
265 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  35.23 
 
 
264 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  32.1 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  32.1 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  32.1 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
262 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  37.12 
 
 
264 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.47 
 
 
266 aa  152  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  33.47 
 
 
266 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  33.47 
 
 
266 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.73 
 
 
266 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.04 
 
 
276 aa  151  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  36.89 
 
 
253 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.73 
 
 
266 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.59 
 
 
265 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
260 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  34.21 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.93 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  36.55 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  36.47 
 
 
260 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36 
 
 
262 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  38.14 
 
 
258 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 
264 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  36.19 
 
 
502 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  36.19 
 
 
502 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  32.63 
 
 
261 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.58 
 
 
264 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  38.05 
 
 
283 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6491  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  32.46 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.353302  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
285 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.23 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
265 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 
260 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  35.17 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
270 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  37.61 
 
 
246 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  36.12 
 
 
260 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
266 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3808  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 
257 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
266 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
266 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  35.17 
 
 
264 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>