More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4550 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  57.66 
 
 
266 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  57.3 
 
 
295 aa  301  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  55.11 
 
 
268 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  56.2 
 
 
267 aa  300  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 
265 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  56.32 
 
 
265 aa  291  1e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  52.92 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  236  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  51.57 
 
 
257 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  43.32 
 
 
262 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  47.6 
 
 
262 aa  225  8e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 
265 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  48.64 
 
 
255 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  44.36 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  44.11 
 
 
263 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  41.24 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  45.58 
 
 
256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  40.66 
 
 
264 aa  194  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  40.54 
 
 
277 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.49 
 
 
276 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  42.36 
 
 
286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.55 
 
 
283 aa  177  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 
283 aa  175  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.57 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  36.86 
 
 
266 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  35.38 
 
 
263 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.4 
 
 
282 aa  157  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0661  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 
276 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126579  hitchhiker  0.00355564 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13330  amino acid-binding protein  32.72 
 
 
291 aa  152  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0378  extracellular solute-binding protein  35.32 
 
 
294 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.150141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  34.2 
 
 
266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.83 
 
 
266 aa  142  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  34.2 
 
 
266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  34.2 
 
 
266 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  34.2 
 
 
285 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  34.2 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  33.83 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.95 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  33.83 
 
 
266 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  33.46 
 
 
266 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.83 
 
 
285 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.83 
 
 
266 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.69 
 
 
264 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2908  cystine transporter subunit  35.8 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.647057  normal  0.0539473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  33.22 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  32.84 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.19 
 
 
265 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  32.95 
 
 
265 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  35.22 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.91 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.21 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.84 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  34.6 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  36.82 
 
 
257 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06880  amino acid-binding protein  32.91 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0612376  normal  0.365115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  34.18 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.65 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  34.18 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.77 
 
 
247 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0534  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
261 aa  125  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.09 
 
 
248 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.36 
 
 
268 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.78 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.78 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.78 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.78 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
246 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
253 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  35.24 
 
 
247 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.74 
 
 
248 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
276 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  30.26 
 
 
252 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
246 aa  122  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.19 
 
 
247 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 
254 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1458  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 
269 aa  122  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000125438  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4844  extracellular solute-binding protein family 3  31.78 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.732367  normal  0.095648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.37 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.44 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1819  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.4 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309777  normal  0.651618 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>