More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0564 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0564  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.323644  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1630  extracellular solute-binding protein  83.54 
 
 		 247 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0283  extracellular solute-binding protein  80.66 
 
 		 248 aa  407  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.37574  hitchhiker  0.000912938 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1775  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.742308  hitchhiker  0.000324527 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0143  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1806  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0263139  unclonable  0.0000000066734 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0414  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0283  extracellular solute-binding protein  39.17 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.274556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0013  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0340  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.419937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0754  extracellular solute-binding protein  33.49 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.00633321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1164  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.065416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0864  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.887861  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0172  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0067  extracellular solute-binding protein  29.92 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.571905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0820  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1739  extracellular solute-binding protein  32.92 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.376685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  32.24 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 260 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 		 254 aa  92  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.23 
 
 		 265 aa  92  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 		 272 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  26.59 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 264 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  27.02 
 
 		 502 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  27.02 
 
 		 502 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  22.98 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  30.84 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 276 aa  85.5  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  28.76 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0210  hypothetical protein  27.6 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  25.82 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1122  extracellular solute-binding protein family 3  25.79 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  22.18 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  27.65 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  23.68 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.54 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.54 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3233  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.05 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.54 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1565  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.29 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.29 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.11 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.57 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  25.75 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  27.98 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.75 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.88 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.75 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2345  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.949438  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0228  lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.72 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0255  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  28.34 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2189  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.300771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  25.76 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.75 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  25.42 
 
 		 736 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5308  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000841131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4198  extracellular solute-binding protein  22.49 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4765  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.35 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3547  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0208  basic amino acid ABC transporter periplasmic protein  21.63 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2879  putative amino acid binding protein  24.32 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.336803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  25.53 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5953  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  25.1 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>