More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0501 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  45.54 
 
 
257 aa  193  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  41.96 
 
 
268 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  42.92 
 
 
247 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.49 
 
 
513 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.92 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  42.37 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.24 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.24 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.24 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  42.32 
 
 
501 aa  172  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 
264 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 
264 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.82 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.82 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.82 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.82 
 
 
250 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  39.06 
 
 
284 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.16 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
250 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  38.77 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
260 aa  161  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  37.36 
 
 
271 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 
247 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  39.09 
 
 
263 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  38.59 
 
 
271 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.92 
 
 
272 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
247 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.22 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  38.94 
 
 
248 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
247 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.6 
 
 
247 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  39.39 
 
 
252 aa  158  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.74 
 
 
248 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.93 
 
 
248 aa  152  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.99 
 
 
248 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  37.69 
 
 
269 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  38.26 
 
 
246 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.96 
 
 
247 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.89 
 
 
248 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  36.68 
 
 
248 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.55 
 
 
248 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.67 
 
 
260 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.24 
 
 
248 aa  148  9e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.61 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.96 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  38.36 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.24 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.24 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.24 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.24 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  35.96 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  32.98 
 
 
287 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  39.55 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.8 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  38.49 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.18 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  33.46 
 
 
283 aa  145  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  40.27 
 
 
264 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
260 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  36.96 
 
 
285 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.46 
 
 
251 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  38.91 
 
 
260 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  38.3 
 
 
267 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  37.27 
 
 
283 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  41.04 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3102  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  34.19 
 
 
272 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.7 
 
 
276 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 
246 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  31.82 
 
 
272 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3756  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 
265 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.720347  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  35.81 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.33 
 
 
276 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  36.97 
 
 
244 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>