More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1148 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  72.96 
 
 		 276 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  74.44 
 
 		 270 aa  383  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  75.74 
 
 		 249 aa  376  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  51.87 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 		 282 aa  247  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  52.74 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  52.74 
 
 		 295 aa  244  6.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.63 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.63 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  35.37 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.98 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  33.1 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  38.03 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.98 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  43.09 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  35.11 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  35.66 
 
 		 490 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  31.88 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  30.86 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.33 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  38.01 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.93 
 
 		 490 aa  109  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  31.95 
 
 		 278 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  30.7 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  30.7 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  28.19 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  39.88 
 
 		 501 aa  105  6e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  30 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.95 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.88 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  27.24 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  29.77 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.1 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.78 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  28.25 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  28.79 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  28.19 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  26.72 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.68 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  29.74 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.74 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  31.62 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  24.91 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  27.56 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  32.83 
 
 		 485 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  41.82 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.95 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.88 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.72 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.72 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 222 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  31 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.3 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  26.72 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.72 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>