More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0357 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 270 aa  541  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  78.52 
 
 		 276 aa  441  1e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  74.44 
 
 		 270 aa  419  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  77.82 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  47.6 
 
 		 282 aa  253  3e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  54.43 
 
 		 292 aa  250  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  52.07 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  54.85 
 
 		 295 aa  248  6e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  49.81 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.12 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.12 
 
 		 259 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.68 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.68 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.68 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.68 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.68 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.84 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.4 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  36 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  34.28 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  38.1 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  35.62 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  42.94 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  41.44 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  33.62 
 
 		 244 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  32.31 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.95 
 
 		 490 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 485 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 485 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  29.33 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.9 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  35.68 
 
 		 485 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  32.47 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  31.53 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 		 490 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  35.23 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.2 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.5 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  38.14 
 
 		 501 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  31.6 
 
 		 278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31.4 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.62 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  29.63 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2212  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  32.03 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.43 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30.53 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  33.62 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.43 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  29.52 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  31.15 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.34 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  27.95 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.17 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.43 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.43 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  33.62 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.61 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.17 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  36.84 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>