More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0906 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
279 aa  559  1e-158  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  50.19 
 
 
270 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  49.59 
 
 
299 aa  237  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  44.9 
 
 
292 aa  236  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  46.64 
 
 
282 aa  235  6e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  47.94 
 
 
276 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  51.68 
 
 
295 aa  232  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  53.88 
 
 
270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  42.61 
 
 
261 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 
288 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  39.23 
 
 
260 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.61 
 
 
259 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.59 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
295 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.59 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.59 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.59 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  40.59 
 
 
259 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.17 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  40.43 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  40.69 
 
 
259 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.3 
 
 
259 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 
247 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  40.87 
 
 
260 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 
246 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  37.39 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  40.18 
 
 
244 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 
250 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.74 
 
 
278 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  37.74 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  38.02 
 
 
501 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  38.43 
 
 
268 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.51 
 
 
485 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  33.83 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  34.21 
 
 
490 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  38.14 
 
 
257 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 
243 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  36.32 
 
 
259 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.2 
 
 
285 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.2 
 
 
266 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.2 
 
 
266 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.2 
 
 
285 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  30.83 
 
 
266 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  30.83 
 
 
266 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  30.83 
 
 
266 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.64 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  39.89 
 
 
485 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  33.19 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
490 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
503 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.04 
 
 
264 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  33.78 
 
 
242 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.97 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  34.06 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.94 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  32.33 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 
271 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  35.62 
 
 
244 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1569  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
264 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.313836 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.23 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  31.39 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  29.7 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  32.88 
 
 
255 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.23 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  35.62 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.42 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  30.08 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  33.33 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  30.53 
 
 
242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  32.31 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  32.31 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0343  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1057  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.898657  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.09 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.68 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34.2 
 
 
247 aa  109  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 
244 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.64 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>