More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2184 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2184  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
295 aa  586  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1803  extracellular solute-binding protein  87.46 
 
 
288 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  38.77 
 
 
244 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
282 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  36.68 
 
 
243 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  35.25 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1328  extracellular solute-binding protein  34.03 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.313303  normal  0.666491 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
260 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
292 aa  127  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  36.89 
 
 
255 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1148  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
270 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.614659 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
295 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 
250 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  37.23 
 
 
242 aa  123  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  33.48 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.62 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.63 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  33.63 
 
 
259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 
261 aa  119  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  33.48 
 
 
241 aa  119  7e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  30.3 
 
 
490 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
246 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.74 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.42 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  30.04 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.21 
 
 
260 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1098  extracellular solute-binding protein  32.08 
 
 
254 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.041078  normal  0.0345837 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  33.78 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
257 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  34.05 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  35.78 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  30.42 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  34.78 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  33.33 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  33.48 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.9 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  33.48 
 
 
250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.05 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
276 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.9 
 
 
243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  30.68 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.47 
 
 
243 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  32.47 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.47 
 
 
278 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  34.31 
 
 
247 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  33.62 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  32.02 
 
 
259 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.79 
 
 
266 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.61 
 
 
265 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
503 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  28.51 
 
 
285 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  36.42 
 
 
258 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
245 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
243 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
243 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  33.63 
 
 
246 aa  106  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
245 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
266 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  33.19 
 
 
243 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1664  extracellular solute-binding protein family 3  26.74 
 
 
294 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0778  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  28.45 
 
 
266 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  28.45 
 
 
266 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  28.45 
 
 
266 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.16 
 
 
264 aa  106  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.02 
 
 
265 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.9 
 
 
244 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1379  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.04 
 
 
243 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  30.25 
 
 
268 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
266 aa  105  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.06 
 
 
243 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
266 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  28.51 
 
 
266 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0327  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
305 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>