More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2452 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  38.31 
 
 
256 aa  186  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  39.53 
 
 
255 aa  185  8e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  42.59 
 
 
251 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  42.59 
 
 
251 aa  175  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  39.31 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  42.21 
 
 
251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  40.91 
 
 
238 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  40.23 
 
 
260 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  38.85 
 
 
246 aa  167  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  42.42 
 
 
260 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  40 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  35.89 
 
 
242 aa  163  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.16 
 
 
259 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.16 
 
 
259 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.4 
 
 
259 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.78 
 
 
259 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.4 
 
 
259 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
259 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  37.69 
 
 
272 aa  151  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 
261 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
242 aa  151  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  39.22 
 
 
247 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.65 
 
 
244 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 
260 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
245 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
245 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  36.41 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 
264 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
244 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  37.12 
 
 
268 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  38.53 
 
 
247 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  34.7 
 
 
244 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
244 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  36.54 
 
 
250 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  38.17 
 
 
264 aa  138  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  33.85 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
244 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
244 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 
265 aa  133  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.24 
 
 
257 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  34.67 
 
 
250 aa  131  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  34.75 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  38.35 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 
246 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 
271 aa  129  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 
243 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.97 
 
 
278 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  31.98 
 
 
501 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 
279 aa  126  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
485 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
485 aa  125  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
249 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.91 
 
 
490 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1210  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 
260 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1967  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2074  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1701  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.74 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  31.5 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.84 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.03 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  33.03 
 
 
254 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.18 
 
 
513 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.33 
 
 
492 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2075  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  32.58 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.61 
 
 
261 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.61 
 
 
261 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.19 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  34.47 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.61 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.19 
 
 
493 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  36.56 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  33.6 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2561  extracellular solute-binding protein family 3  32.47 
 
 
263 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.52541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 
267 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.09 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 
267 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.09 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  34.06 
 
 
267 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.56 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>