More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0567 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  100 
 
 
278 aa  537  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  98.92 
 
 
278 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  43.33 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  40.7 
 
 
260 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.77 
 
 
264 aa  175  9e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0544  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  40.83 
 
 
501 aa  171  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0576109  unclonable  7.662799999999999e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1455  amino acid ABC transporter periplasmic protein  39.77 
 
 
276 aa  165  8e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000239011  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0584  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.74 
 
 
273 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0380043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 
503 aa  162  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000479447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
485 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.79 
 
 
485 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  38.08 
 
 
271 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  39.85 
 
 
259 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  39.08 
 
 
259 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1454  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.92 
 
 
265 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00353635  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  38.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.55 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  37.26 
 
 
485 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 
261 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.79 
 
 
259 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0655  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.96 
 
 
490 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  37.23 
 
 
250 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 
284 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.04 
 
 
268 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
246 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  37.45 
 
 
260 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  39.91 
 
 
246 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  36.75 
 
 
295 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.46 
 
 
263 aa  135  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  34.7 
 
 
256 aa  135  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  36.32 
 
 
292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  32.21 
 
 
268 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
264 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  32.55 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  33.07 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  39.26 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  32.16 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  33.07 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  32.16 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  37.72 
 
 
257 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 
264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  34.55 
 
 
284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.76 
 
 
266 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
490 aa  126  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0178  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
299 aa  125  7e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.45 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
245 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 
242 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  34.42 
 
 
246 aa  123  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 
272 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  33.07 
 
 
266 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.4 
 
 
248 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  32.27 
 
 
266 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  32.67 
 
 
266 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.51 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.47 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  34.48 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.47 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.47 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  34.93 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1767  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.99488  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.75 
 
 
248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.79 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  34.15 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  33.2 
 
 
255 aa  119  6e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.93 
 
 
248 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34.25 
 
 
247 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.11 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  37.04 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  31.19 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2235  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0981376  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  30.98 
 
 
251 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.11 
 
 
248 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  30.27 
 
 
265 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.7 
 
 
247 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  33.46 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.15 
 
 
244 aa  116  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.05 
 
 
247 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>