More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3027 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 
244 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  98.36 
 
 
244 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  97.95 
 
 
244 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  94.8 
 
 
250 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  90.16 
 
 
244 aa  420  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  90.16 
 
 
244 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  89.75 
 
 
244 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  89.34 
 
 
244 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  78.69 
 
 
242 aa  400  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  76.73 
 
 
245 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  74.69 
 
 
245 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  44.17 
 
 
247 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  46.58 
 
 
246 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  46.12 
 
 
246 aa  169  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  42.15 
 
 
250 aa  169  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0928  extracellular solute-binding protein family 3  40.91 
 
 
254 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  40.8 
 
 
271 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  38.55 
 
 
257 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0489  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
490 aa  157  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  42.52 
 
 
247 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  37.55 
 
 
264 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4225  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.05 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 
259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.47 
 
 
260 aa  145  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  37.02 
 
 
242 aa  145  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4285  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.05 
 
 
259 aa  145  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000352358  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
494 aa  144  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.233096  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  34.13 
 
 
259 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.61 
 
 
259 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.61 
 
 
259 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.61 
 
 
259 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.61 
 
 
259 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 
268 aa  143  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 
264 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  40.91 
 
 
246 aa  143  3e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  36.54 
 
 
263 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 
513 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  37.16 
 
 
259 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  36 
 
 
261 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  39.9 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 
259 aa  138  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.24 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  36.47 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.74 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  37.94 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 
284 aa  135  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  34.52 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  39.91 
 
 
273 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  37.07 
 
 
238 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
260 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  34.4 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  39.29 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  35.16 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0834  CjaC  35.69 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0757  cjaC protein  35.69 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.943565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  38.67 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  34.24 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1431  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.68 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1277  cjaC protein  35.86 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  36.11 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.13 
 
 
244 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1395  amino acid ABC transporter, permease/amino acid-binding protein, putative  38.81 
 
 
485 aa  125  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1692  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 
258 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.29 
 
 
249 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.55 
 
 
243 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.99 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  31.76 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  36.99 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.99 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.74 
 
 
250 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  36.99 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.99 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.74 
 
 
250 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.99 
 
 
243 aa  125  9e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  34.05 
 
 
268 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
255 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.57 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.11 
 
 
253 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.85 
 
 
243 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  36.53 
 
 
243 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1259  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
295 aa  122  5e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.7 
 
 
269 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
485 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
485 aa  122  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  33.79 
 
 
258 aa  122  7e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1863  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
292 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  34.07 
 
 
255 aa  121  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2277  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.06 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  34.44 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>