More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2091 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2091  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.237181  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2092  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein, putative  29.03 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.514591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0316  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000382447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  26.89 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  29.75 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5539  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.83 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.46 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.46 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1010  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3928  extracellular solute-binding protein family 3  28.63 
 
 		 265 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.259325  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1324  amino acid ABC transporter (binding protein)  29.85 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  25.29 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.8 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0949  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.94 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2503  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1531  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.17 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000230414  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2353  extracellular solute-binding protein family 3  30.2 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.09811e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2118  extracellular solute-binding protein family 3  31.37 
 
 		 265 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.137137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 262 aa  105  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0907  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.04 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.455944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.54 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  28.73 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.03 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.27 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0471  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.295976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0578  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.91 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2352  extracellular solute-binding protein family 3  27.57 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.9341599999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 283 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  27.85 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 270 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0360  amino acid ABC transporter periplasmic protein  28.81 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000870142  hitchhiker  0.00010092 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1665  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.88 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  28.85 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0945  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.336039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0812  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00534966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0760  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0753  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00539884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0855  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1035  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041367  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0947  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0908  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00179052  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4430  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.95 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10616  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  26.58 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0759  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.221068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  26.56 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1294  extracellular solute-binding protein family 3  22.5 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0278324  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2849  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 261 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  24.58 
 
 		 266 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  24.58 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  25.83 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  24.58 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 253 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  24.58 
 
 		 285 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  25.65 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  24.58 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  31.82 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0687  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0413327  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  24.79 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2081  histidine kinase  27.66 
 
 		 597 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  27.04 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.706269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>