More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3016 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  65.83 
 
 
252 aa  337  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  65.78 
 
 
249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  67.74 
 
 
254 aa  317  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  67.28 
 
 
254 aa  316  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  63.45 
 
 
246 aa  315  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  60.82 
 
 
247 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  62.98 
 
 
251 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  62.34 
 
 
251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.14 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  41.01 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.37 
 
 
250 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.37 
 
 
250 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  40.55 
 
 
249 aa  144  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
250 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.96 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.71 
 
 
248 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  40 
 
 
264 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  38.99 
 
 
271 aa  142  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.29 
 
 
248 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 
260 aa  142  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  35.62 
 
 
263 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  39.09 
 
 
246 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.22 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.22 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
264 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.47 
 
 
248 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.61 
 
 
247 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.44 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.44 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.78 
 
 
248 aa  138  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 
250 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.32 
 
 
250 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
248 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
247 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  38.81 
 
 
284 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 
281 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.07 
 
 
248 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  36.52 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  37.04 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  36.52 
 
 
264 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.92 
 
 
248 aa  136  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.86 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  35.37 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  36.09 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.57 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0360  extracellular solute-binding protein  36.94 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.6 
 
 
247 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0529  hypothetical protein  34.1 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  35.48 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.67 
 
 
252 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  34.68 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  35.22 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  32.26 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00865  arginine transporter subunit  33.33 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2782  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
243 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0257892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  34.26 
 
 
247 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2736  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0318086  normal  0.950747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0932  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.97 
 
 
248 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 
260 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00871  hypothetical protein  33.33 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0964  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  129  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
245 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.33 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0553  hypothetical protein  32.72 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  32 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 
260 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.39 
 
 
245 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.39 
 
 
245 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.39 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  32.24 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.39 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34.63 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  31.87 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  32.51 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  35.39 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.65 
 
 
513 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4902  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.51 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2280  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.1 
 
 
244 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.09 
 
 
243 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1019  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  31.69 
 
 
243 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>