More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0961 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  47.74 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1402  extracellular solute-binding protein family 3  50 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3134  extracellular solute-binding protein  41.53 
 
 		 267 aa  185  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  39.02 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0861  extracellular solute-binding protein family 3  38.31 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  34.93 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  36.09 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  36.4 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  32.71 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  29.39 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.54 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 		 492 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  34.6 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 247 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3027  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 		 244 aa  122  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0951  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0683  extracellular solute-binding protein  33.05 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.732102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0986  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3392  extracellular solute-binding protein  34.25 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0624048  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  30.38 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.27 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.56 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0972  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 250 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.801508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  32.16 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  33.02 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  29.2 
 
 		 736 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  29.74 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  30.29 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 		 493 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.6 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.6 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.22 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_362  amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  33.49 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000733431  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  28.96 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0419  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.49 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000266261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.17 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0398  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000444097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.01 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1804  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  29.82 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  28.18 
 
 		 727 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.86 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  29.46 
 
 		 481 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.1 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.96 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.1 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  30.18 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  28.46 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  30.2 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0967  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  30.43 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4550  extracellular solute-binding protein family 3  27.74 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000001355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  32.27 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  30.7 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1566  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  31.12 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  31.67 
 
 		 286 aa  99.8  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  29.03 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  27.8 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.57 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  28.32 
 
 		 480 aa  99.4  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  33.92 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  30.52 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  30.52 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  27.94 
 
 		 271 aa  98.6  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5809  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.287013  normal  0.321236 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  25.27 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  26.48 
 
 		 285 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  28.63 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  28.8 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>