More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11360 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  100 
 
 
290 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  59.53 
 
 
294 aa  300  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  43.35 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  43.4 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  36.55 
 
 
282 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  43.41 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0861  extracellular solute-binding protein family 3  37.09 
 
 
257 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3134  extracellular solute-binding protein  42.02 
 
 
267 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  37.13 
 
 
271 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 
272 aa  165  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1402  extracellular solute-binding protein family 3  41.67 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  37.28 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  35.34 
 
 
258 aa  155  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  37.87 
 
 
273 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  38.5 
 
 
247 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  34.62 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.12 
 
 
248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
248 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  37.45 
 
 
260 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.73 
 
 
247 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  39.04 
 
 
257 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.07 
 
 
248 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  36.19 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.78 
 
 
248 aa  132  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  38.29 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
247 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.68 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36 
 
 
248 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 
272 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.56 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
247 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.11 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.82 
 
 
248 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 
260 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0683  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 
279 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.732102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
260 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.22 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.23 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.45 
 
 
254 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  32.52 
 
 
267 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  32.7 
 
 
278 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.23 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  34.09 
 
 
254 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
264 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 
246 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.32 
 
 
278 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0125  extracellular solute-binding protein family 3  30.19 
 
 
270 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  35.14 
 
 
247 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  33.64 
 
 
246 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  31.52 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  31.06 
 
 
271 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.38 
 
 
252 aa  119  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.33 
 
 
251 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  31.13 
 
 
328 aa  119  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.78 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 
247 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.33 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
331 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
331 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  32.42 
 
 
251 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  32.77 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  34.91 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  33.18 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.65 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.75 
 
 
276 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.34 
 
 
286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 
249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  31.39 
 
 
276 aa  112  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>