More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0683 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0683  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
279 aa  570  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.732102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  49.15 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  48.51 
 
 
272 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  39.57 
 
 
282 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2962  extracellular solute-binding protein  43.31 
 
 
287 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0861  extracellular solute-binding protein family 3  39.38 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0592  extracellular solute-binding protein family 3  35.61 
 
 
272 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24310  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  35.07 
 
 
264 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2829  extracellular solute-binding protein family 3  35.66 
 
 
266 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.479003 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18700  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  31.8 
 
 
273 aa  139  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.7204  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3134  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
267 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  36.55 
 
 
273 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0961  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 
258 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.611577  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.62 
 
 
290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  34.13 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1402  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16775  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.95 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
265 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  33.77 
 
 
281 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1959  extracellular solute-binding protein  34.67 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.553895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.47 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 
260 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  32.46 
 
 
247 aa  112  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
264 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 
246 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  31.47 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.16 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0186  extracellular solute-binding protein  30.83 
 
 
251 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  31.78 
 
 
253 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 
260 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 
246 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
254 aa  109  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  29.66 
 
 
267 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
249 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  32.61 
 
 
251 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 
247 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
286 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  31.49 
 
 
309 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2725  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
255 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
261 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  32.59 
 
 
254 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.03 
 
 
251 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
310 aa  106  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1236  ABC-type amino acid transport system, periplasmic component  32.51 
 
 
278 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  34.93 
 
 
263 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 
246 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  30.04 
 
 
242 aa  105  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  31.3 
 
 
247 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  30.4 
 
 
266 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0411  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  29.46 
 
 
238 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  31.25 
 
 
254 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 
248 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
252 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0682  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.56 
 
 
257 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0638  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.56 
 
 
257 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.890453  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  30.18 
 
 
242 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  30.8 
 
 
285 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  31.9 
 
 
260 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  31.25 
 
 
252 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  29.91 
 
 
727 aa  102  9e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1571  extracellular solute-binding protein family 3  33.16 
 
 
249 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  30.17 
 
 
248 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
258 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0429  extracellular solute-binding protein family 3  30.8 
 
 
283 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0824  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
256 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.96 
 
 
245 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.96 
 
 
243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.96 
 
 
245 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.96 
 
 
243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.96 
 
 
243 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4024  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 
270 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.400278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0743  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 
295 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0655438  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4264  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  29.74 
 
 
259 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000272293  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2076  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
266 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.89 
 
 
468 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2711  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.18 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1582  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.18 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4059  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000988465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  29.52 
 
 
243 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3898  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.3817799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3905  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000878527  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4174  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0433211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4376  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000139221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2626  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtI  30.18 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3995  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
259 aa  99.4  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0155411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  29.52 
 
 
243 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0971  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.67 
 
 
259 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0711  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
266 aa  99.4  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.04 
 
 
266 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3807  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>