More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1706 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 		 252 aa  512  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  73.88 
 
 		 248 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  78.85 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  64.14 
 
 		 247 aa  327  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  68 
 
 		 247 aa  322  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  68 
 
 		 247 aa  322  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 248 aa  319  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.7 
 
 		 248 aa  318  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.75 
 
 		 247 aa  316  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.9 
 
 		 248 aa  316  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.3 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.51 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.51 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  64.16 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  58.33 
 
 		 253 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.23 
 
 		 250 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.23 
 
 		 250 aa  297  9e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.96 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.79 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.79 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.79 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.79 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  60.79 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.16 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  62.16 
 
 		 250 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  61.71 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  49.4 
 
 		 247 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  54.87 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  52.63 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  47.98 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  50.22 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  44.13 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 254 aa  191  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  43.67 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  42.34 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  38.78 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 		 513 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  39.37 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  37 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  38.94 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  37.84 
 
 		 501 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  36.18 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  37.84 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  35.27 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4160  extracellular solute-binding protein  38.01 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.757716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  36.84 
 
 		 281 aa  148  8e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  34.98 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2050  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.77 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0241787  normal  0.446872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  35.43 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  38.25 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  33.47 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  34.53 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0329  extracellular solute-binding protein family 3  37.17 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  34.86 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  32.95 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1655  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  36 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.568539 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2235  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  33.06 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.85 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 246 aa  132  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  34.24 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.15 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2979  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  33.99 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3010  extracellular solute-binding protein  35.11 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2456  extracellular solute-binding protein  30.89 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6986  extracellular solute-binding protein family 3  34.67 
 
 		 271 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821047  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0296  ABC basic amino acid transporter, periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.511931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0326  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  33.99 
 
 		 480 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2291  extracellular solute-binding protein family 3  33.07 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0885  extracellular solute-binding protein family 3  34.23 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000379801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1525  extracellular solute-binding protein  32.3 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.490796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  36.2 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.66 
 
 		 250 aa  122  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.17 
 
 		 493 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  33.47 
 
 		 481 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.45 
 
 		 250 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.28 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 		 260 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>