More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1869 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.96 
 
 
492 aa  205  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.17 
 
 
493 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  44.17 
 
 
468 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  42.26 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  40.17 
 
 
271 aa  182  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  38.2 
 
 
714 aa  181  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0438  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  41.89 
 
 
480 aa  180  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.126368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  40.98 
 
 
264 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0440  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  42.92 
 
 
481 aa  176  4e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  40.96 
 
 
727 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1126  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 
284 aa  169  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  36.54 
 
 
263 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  42.27 
 
 
736 aa  166  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1495  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.55 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000566563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.86 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1600  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.86 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.11 
 
 
248 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.11 
 
 
248 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.11 
 
 
248 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  42.11 
 
 
248 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.67 
 
 
248 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2878  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.07 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0116852  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1584  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.07 
 
 
248 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  41.23 
 
 
248 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  36.4 
 
 
268 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  38.98 
 
 
247 aa  155  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.17 
 
 
250 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  40.09 
 
 
247 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.59 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 
254 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.02 
 
 
250 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  38.86 
 
 
246 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  37.39 
 
 
247 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  39.55 
 
 
257 aa  150  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4284  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.4 
 
 
250 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3441  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.4 
 
 
250 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4082  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.4 
 
 
250 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314608  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0098  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
487 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000321849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1594  extracellular solute-binding protein  42.51 
 
 
233 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  39.21 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2357  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.04 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1156  glutamine ABC transporter periplasmic protein  37.27 
 
 
248 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  36.84 
 
 
248 aa  145  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  35.96 
 
 
248 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2141  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
247 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0343212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2798  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 
254 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.39 
 
 
513 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2452  extracellular solute-binding protein family 3  37.15 
 
 
259 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1918  extracellular solute-binding protein family 3  36.28 
 
 
248 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2855  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 
249 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3699  glutamine ABC transporter periplasmic protein  33.76 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0756284  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2391  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  37.5 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  34.33 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  35.09 
 
 
285 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
252 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  34.23 
 
 
501 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  36.09 
 
 
246 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  34.07 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1706  glutamine ABC transporter periplasmic protein  34.86 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.114527  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0501  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 
281 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  32.71 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4752  extracellular solute-binding protein family 3  32.57 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000170582  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  34.04 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.49 
 
 
244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 
244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3517  extracellular solute-binding protein family 3  34.8 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  33.08 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1040  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0413  homoserine kinase (HSK; HK)  33.59 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.862983  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
245 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 
243 aa  125  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38840  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  33.7 
 
 
272 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.621896 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0592  amino acid ABC transporter, permease/substrate-binding lipoprotein  31.03 
 
 
252 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000143889  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0581  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.45 
 
 
278 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.143423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 
286 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4410  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 
251 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  31.93 
 
 
272 aa  122  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0567  amino acid ABC transporter  31.7 
 
 
278 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11360  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  32.27 
 
 
290 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144563  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5123  extracellular solute-binding protein family 3  33.05 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  35.45 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>