More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1818 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  74.8 
 
 		 272 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  76.23 
 
 		 272 aa  403  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  68.86 
 
 		 273 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  61.17 
 
 		 271 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  58.89 
 
 		 268 aa  341  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  57.09 
 
 		 265 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  58.36 
 
 		 266 aa  326  3e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  55.6 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  55.56 
 
 		 266 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  55.19 
 
 		 266 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  54.81 
 
 		 266 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  54.44 
 
 		 266 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  37.05 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 268 aa  191  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  39.19 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  36.36 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  35.08 
 
 		 273 aa  179  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  36.78 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  38.61 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  35.83 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  39.3 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  38.7 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  38.12 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  31.34 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  34.17 
 
 		 262 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30.6 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  35.93 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  34.73 
 
 		 250 aa  139  4.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.73 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  34.84 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  34.09 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.44 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  34.09 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  32.36 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  34.11 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  33.84 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.57 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  33.7 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  32.03 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  29.55 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  29.8 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  30.68 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.6 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  31.75 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 		 513 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.17 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  28.46 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 		 307 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  28.06 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  28.79 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  30.12 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1475  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0984243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  30.94 
 
 		 501 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1044  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.48 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2589  extracellular solute-binding protein family 3  30.92 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.67 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  30.3 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.67 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.67 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0919  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  35.29 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3442  extracellular solute-binding protein  34.39 
 
 		 285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  32.44 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.15 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1912  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 		 485 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000291813  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1946  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.3 
 
 		 485 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3053  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000807518  normal  0.0316275 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  25.69 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2512  putative cyclohexadienyl dehydratase precursor signal peptide protein  30.2 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.204589  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  25.69 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  25.69 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  29.12 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.3 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0882  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00121366  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.84 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  25.69 
 
 		 266 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  25.3 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  32.88 
 
 		 283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  33.64 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  25.3 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1050  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875025  normal  0.0927945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.32 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.19 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.19 
 
 		 264 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>