More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1196 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  90.23 
 
 
256 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  89.84 
 
 
256 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  63.33 
 
 
254 aa  326  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  51.56 
 
 
269 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  50.83 
 
 
281 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
268 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  38.16 
 
 
268 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  35.56 
 
 
273 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
250 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  33.91 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  35.74 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  35.55 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.48 
 
 
250 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
250 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  34.78 
 
 
272 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  30.49 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  35.38 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
266 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  30.08 
 
 
246 aa  119  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  32.5 
 
 
258 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 
272 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  34.36 
 
 
266 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  35.59 
 
 
268 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  33.62 
 
 
248 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  34.36 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
266 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  32.75 
 
 
273 aa  116  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  33.92 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  35.37 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  35.37 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.58 
 
 
254 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
265 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  34.1 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  32.9 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  33.78 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1094  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  34.56 
 
 
258 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382529  normal  0.0677014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  32.22 
 
 
250 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3775  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.77 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.361266  hitchhiker  0.000380628 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  32.88 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  33.18 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  33.02 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  33.19 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4486  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.37 
 
 
261 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  29.11 
 
 
247 aa  110  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
258 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
261 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 
258 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1429  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.77 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0594365  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
246 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
276 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4626  arginine/ornithine binding protein AotJ  32.75 
 
 
259 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3991  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  35.77 
 
 
261 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4912  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 
254 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3578  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.52 
 
 
258 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.930436  normal  0.442967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  30.45 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
266 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.3 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.05 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.05 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.3 
 
 
286 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.05 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.82 
 
 
266 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05529  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  30.53 
 
 
247 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.05 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  33.05 
 
 
243 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2056  extracellular solute-binding protein family 3  33.19 
 
 
257 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 
243 aa  105  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
266 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  30.45 
 
 
285 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2289  extracellular solute-binding protein family 3  32.35 
 
 
257 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019267  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  29.13 
 
 
248 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  29.22 
 
 
266 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
267 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0854  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.67 
 
 
282 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  29.22 
 
 
266 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  29.22 
 
 
266 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  35.15 
 
 
246 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
264 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
245 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0168  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
247 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>