More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0836 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0906  amino acid-binding protein  99.61 
 
 
256 aa  511  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0836  amino acid-binding protein  100 
 
 
256 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.462057  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1196  amino acid-binding protein  89.84 
 
 
256 aa  464  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.166337  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0904  glutamine-binding periplasmic protein  65.42 
 
 
254 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.207514  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  52.34 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  51.25 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  37.78 
 
 
268 aa  162  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
268 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0300  extracellular solute-binding protein  34.93 
 
 
250 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.100336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0282  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  34.5 
 
 
250 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0338349  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0860  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.599972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0305  extracellular solute-binding protein  34.35 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409143  normal  0.868034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  36.09 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1459  extracellular solute-binding protein family 3  31.28 
 
 
246 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  33.48 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1824  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0824863  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 
272 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  33.2 
 
 
266 aa  126  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  35.9 
 
 
266 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
272 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2053  extracellular solute-binding protein family 3  33.93 
 
 
271 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2306  extracellular solute-binding protein  30.49 
 
 
246 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000079937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  32.88 
 
 
266 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 
266 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.04 
 
 
266 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0311  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 
248 aa  121  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127977  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  35.04 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  34.36 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  33.33 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4928  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  hitchhiker  0.0000000841601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  34.36 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  32.75 
 
 
273 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 
250 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  34.53 
 
 
265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  33.98 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0588  extracellular solute-binding protein family 3  29.92 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00341778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1658  extracellular solute-binding protein  34.16 
 
 
243 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000026827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68070  putative periplasmic binding protein  34.93 
 
 
250 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467705  normal  0.0215943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5891  putative periplasmic binding protein  34.93 
 
 
250 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0589  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0251025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0727  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00114827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  31.05 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1070  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.89 
 
 
263 aa  116  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.623597  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  31.05 
 
 
266 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5358  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.58 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0771  extracellular solute-binding protein  32.61 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000484393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  31.96 
 
 
266 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  34.08 
 
 
268 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2066  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  30.83 
 
 
258 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0131  glutamine transport system substrate-binding protein  34.72 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210199  normal  0.0525108 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0032  extracellular solute-binding protein  32.74 
 
 
276 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1588  extracellular solute-binding protein  31.7 
 
 
260 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18770  extracellular solute-binding protein family 3  29.48 
 
 
244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  29.76 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  32 
 
 
268 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  30.74 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3166  extracellular solute-binding protein  34.54 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.190587  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1869  extracellular solute-binding protein family 3  34.2 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000802311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1148  extracellular solute-binding protein  34.68 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.09 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  35.71 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3760  extracellular solute-binding protein  35.71 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000882813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3397  extracellular solute-binding protein  34.51 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  34.4 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  33.93 
 
 
246 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  30.59 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  32.3 
 
 
286 aa  109  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
258 aa  109  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4270  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
250 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  hitchhiker  0.00000000000000985175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1758  extracellular solute-binding protein family 3  32.46 
 
 
247 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.809792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  32.35 
 
 
242 aa  108  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  33.64 
 
 
247 aa  108  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  32.3 
 
 
286 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.51 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1806  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  32.66 
 
 
468 aa  108  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000163155  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3406  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.97 
 
 
251 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.940811  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0955  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  32.3 
 
 
268 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0776363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1345  extracellular solute-binding protein family 3  28.34 
 
 
244 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.706269 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.08 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1361  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
257 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0031  extracellular solute-binding protein  41.79 
 
 
272 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.246666  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
275 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  30.08 
 
 
243 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>