More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1835 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1835  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 262 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0545252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0236  extracellular solute-binding protein  71.26 
 
 		 266 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2490  extracellular solute-binding protein family 3  36.14 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1818  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0079129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1385  extracellular solute-binding protein  33.98 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00529871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3696  extracellular solute-binding protein  34.34 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589095  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2022  extracellular solute-binding protein  34.71 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.167722  normal  0.899953 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1344  extracellular solute-binding protein family 3  34 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.752805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5815  putative ABC transporter binding protein subunit  31.32 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.387818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0441  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 266 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4898  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67050  putative binding protein component of ABC transporter  30.57 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5024  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.65 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0124  extracellular solute-binding protein family 3  32.21 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0375  extracellular solute-binding protein  31.42 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5074  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.599311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0814  extracellular solute-binding protein  33.19 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00687374  normal  0.141124 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05952  ABC amino acid transporter periplasmic ligand binding protein  30.8 
 
 		 272 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000216  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  30 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.909844  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0202  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  30.2 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.55601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2287  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  30.59 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  32.47 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0445  extracellular solute-binding protein  30.12 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2685  extracellular solute-binding protein family 3  30.34 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0288477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0242  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.310723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0227  cystine transporter subunit  31.62 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00670463 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.37 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0477  extracellular solute-binding protein family 3  27.35 
 
 		 278 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.225572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3070  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.966648  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0251  cystine transporter subunit  31.2 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2597  extracellular solute-binding protein family 3  27.2 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189611  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  32.12 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3959  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4985  cystine transporter subunit  30.34 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.916643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  31.84 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  33.46 
 
 		 268 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0161  extracellular solute-binding protein family 3  31.4 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.95 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0800  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.51 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4123  cyclohexadienyl dehydratase  28.74 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0829887  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3016  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 246 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.032906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4927  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  30.61 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3886  amino acid ABC transporter permease  27.35 
 
 		 501 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3321  extracellular solute-binding protein family 3  29.18 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4274  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 258 aa  95.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36200  putative binding protein component of ABC transporter  29.8 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4582  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 		 297 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000918358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  32.29 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  32.29 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  32.29 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2389  extracellular solute-binding protein family 3  29.36 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.68817  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  31.56 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  29.39 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3333  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.166718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30.21 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2071  extracellular solute-binding protein  31.44 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30.21 
 
 		 295 aa  92.4  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  31.15 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  31.51 
 
 		 279 aa  92.4  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2775  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.96 
 
 		 283 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.550613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  31.05 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  32.02 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.3 
 
 		 748 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0100  prephenate dehydratase  30.63 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688966  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2503  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.98 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  29.72 
 
 		 281 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0906  extracellular solute-binding protein  37.35 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.663665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2438  extracellular solute-binding protein  35.06 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2214  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1594  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3891  Arogenate dehydratase  28.34 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.95 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  28 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.95 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  28 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.95 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  28 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>