More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1633 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  100 
 
 		 500 aa  1034    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.97 
 
 		 242 aa  292  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.96 
 
 		 241 aa  286  8e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  55.47 
 
 		 262 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  55.78 
 
 		 247 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  54.36 
 
 		 258 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0693  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 		 249 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413615  normal  0.685528 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.74 
 
 		 242 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  53.88 
 
 		 253 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  54.1 
 
 		 249 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  54.92 
 
 		 254 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  55.38 
 
 		 247 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.92 
 
 		 243 aa  274  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  54.73 
 
 		 262 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.09 
 
 		 245 aa  273  5.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  54.73 
 
 		 262 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 254 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  54.51 
 
 		 254 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  54.51 
 
 		 254 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.1 
 
 		 251 aa  272  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  53.01 
 
 		 252 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 284 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  54.92 
 
 		 254 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.1 
 
 		 257 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.37 
 
 		 244 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  54.55 
 
 		 257 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  54.51 
 
 		 253 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  52.03 
 
 		 245 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  53.25 
 
 		 250 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.29 
 
 		 253 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  51.2 
 
 		 246 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  55.33 
 
 		 242 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  54.32 
 
 		 262 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  53.72 
 
 		 258 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  52.59 
 
 		 247 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  53.72 
 
 		 258 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  54.55 
 
 		 257 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 270 aa  270  5e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  54.29 
 
 		 251 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.25 
 
 		 251 aa  270  5.9999999999999995e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  54.13 
 
 		 269 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  55.1 
 
 		 243 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  55.33 
 
 		 254 aa  269  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.88 
 
 		 253 aa  269  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 246 aa  269  8.999999999999999e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  53.72 
 
 		 273 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  51.21 
 
 		 253 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  53.23 
 
 		 246 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  53.91 
 
 		 263 aa  269  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  53.41 
 
 		 256 aa  269  1e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  54.1 
 
 		 242 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  53.31 
 
 		 256 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  52.65 
 
 		 258 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  52.02 
 
 		 259 aa  268  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 269 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  53.31 
 
 		 241 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  53.01 
 
 		 273 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  54.29 
 
 		 257 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  53.31 
 
 		 241 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.69 
 
 		 244 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  53.44 
 
 		 253 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 251 aa  267  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  52.46 
 
 		 247 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  53.04 
 
 		 251 aa  267  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  52.85 
 
 		 259 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  54.13 
 
 		 241 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  56.28 
 
 		 243 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  53.5 
 
 		 246 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  52.03 
 
 		 255 aa  266  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  54.51 
 
 		 263 aa  266  7e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  52.21 
 
 		 252 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 252 aa  266  8e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  52.21 
 
 		 252 aa  266  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  52.21 
 
 		 252 aa  266  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 253 aa  266  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0204  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.26 
 
 		 239 aa  266  8e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.701946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 256 aa  266  8e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 252 aa  266  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  52.63 
 
 		 256 aa  266  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 252 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  51.03 
 
 		 244 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 249 aa  265  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  54.1 
 
 		 253 aa  265  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  53.11 
 
 		 254 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  51.22 
 
 		 247 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 252 aa  265  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  53.91 
 
 		 254 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000214  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.4 
 
 		 244 aa  265  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  52.21 
 
 		 252 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2072  ABC transporter related  52.03 
 
 		 249 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0159024  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  53.91 
 
 		 254 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  54.73 
 
 		 244 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.38 
 
 		 259 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 252 aa  265  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.21 
 
 		 252 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 248 aa  264  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  51.82 
 
 		 243 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  53.2 
 
 		 263 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.1 
 
 		 243 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>