More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2207 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  100 
 
 		 242 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  80.99 
 
 		 256 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  78.1 
 
 		 251 aa  394  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  78.1 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  76.45 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  76.45 
 
 		 257 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  76.45 
 
 		 254 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  76.45 
 
 		 242 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  77.69 
 
 		 244 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  77.27 
 
 		 251 aa  384  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  74.38 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  74.79 
 
 		 258 aa  380  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  77.69 
 
 		 264 aa  380  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  74.79 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  73.55 
 
 		 259 aa  378  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  73.55 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  75.21 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  72.31 
 
 		 247 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  73.14 
 
 		 249 aa  370  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  72.31 
 
 		 247 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  72.31 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  71.72 
 
 		 274 aa  367  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  76.03 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  71.49 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  70.66 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  71.9 
 
 		 256 aa  362  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  69.42 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  70.25 
 
 		 270 aa  362  3e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  69.01 
 
 		 252 aa  358  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.26 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  71.07 
 
 		 250 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  68.6 
 
 		 242 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  65.7 
 
 		 244 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  64.46 
 
 		 244 aa  333  1e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  65.43 
 
 		 252 aa  325  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  63.87 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  61.16 
 
 		 253 aa  314  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  62.08 
 
 		 249 aa  314  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  61.16 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  62.08 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.58 
 
 		 263 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  62.81 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1100  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  61.73 
 
 		 243 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  61.16 
 
 		 255 aa  309  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  59.17 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  62.18 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  63.52 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  60.42 
 
 		 244 aa  307  8e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  61.67 
 
 		 247 aa  307  8e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  59.09 
 
 		 243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  60.33 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  60.83 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  58.23 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  61.25 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  60.49 
 
 		 243 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  59.75 
 
 		 263 aa  305  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  305  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.42 
 
 		 250 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  59.5 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60.83 
 
 		 242 aa  305  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.09 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  61.25 
 
 		 244 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  61.67 
 
 		 254 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  63.64 
 
 		 252 aa  304  7e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  59.09 
 
 		 242 aa  304  9.000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  59.58 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  59.17 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2570  ABC transporter related  61.67 
 
 		 241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0998599  normal  0.044732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.74 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  59.5 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  59.17 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  61 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0567  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0593  ABC transporter related  61.25 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.180749  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.17 
 
 		 253 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  58.92 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  61.89 
 
 		 244 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.58 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  58.92 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  58.92 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  302  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  60.33 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  60.08 
 
 		 243 aa  301  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  59.58 
 
 		 242 aa  301  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  63.33 
 
 		 241 aa  301  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  58.92 
 
 		 262 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60 
 
 		 253 aa  300  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.17 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2923  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  63.75 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.524102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>