More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6680 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  506  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  79.92 
 
 		 245 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  59.2 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  56.61 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.02 
 
 		 245 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  58.33 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.77 
 
 		 251 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  57.5 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 245 aa  281  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  56.43 
 
 		 241 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  60.17 
 
 		 244 aa  281  8.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  57.5 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.57 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  57.55 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  57.32 
 
 		 252 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  56.73 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  58.26 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  54.44 
 
 		 259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  57.14 
 
 		 256 aa  276  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  56 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2057  ABC transporter related  57.08 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  57.08 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3514  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 240 aa  275  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  55.37 
 
 		 242 aa  275  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  57.32 
 
 		 239 aa  275  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  56.1 
 
 		 270 aa  275  6e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.61 
 
 		 257 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  56.1 
 
 		 261 aa  274  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  54.69 
 
 		 246 aa  274  9e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  58.33 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  54.22 
 
 		 255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  54.92 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  56.2 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  55.65 
 
 		 256 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  59.83 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  55.79 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.34 
 
 		 263 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  57.44 
 
 		 257 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.83 
 
 		 240 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  56.73 
 
 		 254 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  55.47 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  53.72 
 
 		 243 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3357  ABC transporter related  56.67 
 
 		 240 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  55.38 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  55.97 
 
 		 244 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1633  ABC transporter related  53.25 
 
 		 500 aa  271  9e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  55.89 
 
 		 260 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 240 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.02 
 
 		 249 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  55.95 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  53.9 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  54.8 
 
 		 255 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  56.67 
 
 		 240 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  53.41 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3744  ATPase  57.61 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.589771  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.22 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2182  ABC transporter related  55.97 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  56.56 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  56.56 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.15 
 
 		 254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.19 
 
 		 244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  56.67 
 
 		 249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  57.2 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  55.29 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  53.94 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  54.58 
 
 		 242 aa  268  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.51 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  53.04 
 
 		 246 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 273 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  56.45 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  55.97 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  55.56 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  55.74 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  55.56 
 
 		 254 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  56.15 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  55.97 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  56.57 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  52.26 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.77 
 
 		 240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  54.44 
 
 		 253 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  55.02 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2758  ABC transporter related  53.75 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.4 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  54.92 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  55.74 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  53.94 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  55.74 
 
 		 254 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 284 aa  265  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  55.83 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>