More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3519 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  81.97 
 
 		 244 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  72.02 
 
 		 247 aa  353  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  69.55 
 
 		 247 aa  353  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  69.55 
 
 		 252 aa  352  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  71.19 
 
 		 257 aa  349  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  70.37 
 
 		 251 aa  347  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  69.83 
 
 		 257 aa  345  3e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  68.31 
 
 		 262 aa  344  7e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  69.14 
 
 		 248 aa  344  7e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  67.77 
 
 		 258 aa  342  2e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  68.6 
 
 		 242 aa  340  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  66.67 
 
 		 261 aa  340  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  67.21 
 
 		 274 aa  338  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  68.72 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  68.72 
 
 		 250 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  67.77 
 
 		 249 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  66.53 
 
 		 251 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  65.84 
 
 		 251 aa  334  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  65.02 
 
 		 270 aa  333  1e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  64.46 
 
 		 242 aa  333  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  64.75 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  64.75 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  64.61 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  65.43 
 
 		 255 aa  332  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  64.88 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  65.02 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  63.93 
 
 		 244 aa  328  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  62.96 
 
 		 256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.49 
 
 		 264 aa  326  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  68.31 
 
 		 280 aa  321  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  62.96 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  64.75 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  58.68 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.43 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  62.4 
 
 		 245 aa  298  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.66 
 
 		 244 aa  298  6e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2585  ABC transporter related  58.44 
 
 		 244 aa  291  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60.74 
 
 		 245 aa  291  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.35 
 
 		 263 aa  291  7e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  61.04 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  59.67 
 
 		 244 aa  291  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.98 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  57.92 
 
 		 251 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  62.5 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  57.44 
 
 		 241 aa  289  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  57.5 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4373  ABC transporter related  58.85 
 
 		 264 aa  288  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  58.02 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.92 
 
 		 249 aa  288  7e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  56.63 
 
 		 252 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0610  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  54.81 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000852902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  57.02 
 
 		 247 aa  286  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  56.79 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.35 
 
 		 256 aa  287  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  59.18 
 
 		 248 aa  286  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  55.42 
 
 		 240 aa  286  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.26 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  57.68 
 
 		 247 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  55.19 
 
 		 242 aa  285  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4262  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00783268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  55.74 
 
 		 244 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0719  glutamate/aspartate ABC transporter ATP-binding protein  59.34 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.02 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0462  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.97 
 
 		 255 aa  284  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  58.09 
 
 		 246 aa  284  9e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4546  ABC transporter related  56.38 
 
 		 260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.0112462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  58.92 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  55.37 
 
 		 242 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4480  ABC transporter related  56.79 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.43 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  56.61 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.44 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  57.02 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  58.09 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4441  ABC transporter related  58.02 
 
 		 255 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103673 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  56.63 
 
 		 259 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  58.26 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.17 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  56.43 
 
 		 252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  58.26 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  55.1 
 
 		 265 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  56.43 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  57.14 
 
 		 252 aa  281  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  57.44 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1563  ABC transporter related  57.44 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0142744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4538  ABC transporter-like  54.92 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247485  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3896  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55 
 
 		 240 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000617996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  54.13 
 
 		 243 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4057  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000175078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3903  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000661212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4374  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00801919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4283  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.58 
 
 		 240 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000077342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>