More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3983 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  76.73 
 
 		 247 aa  391  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  75.31 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1125  ABC transporter-like protein  75.1 
 
 		 250 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.168368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  73.98 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  74.29 
 
 		 248 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  75.1 
 
 		 247 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1395  ABC transporter related  73.66 
 
 		 251 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  73.06 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  72.36 
 
 		 261 aa  377  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  73.06 
 
 		 254 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  71.49 
 
 		 259 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  73.55 
 
 		 242 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  72.02 
 
 		 244 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  72.69 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  72.18 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  72.73 
 
 		 257 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  71.49 
 
 		 251 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  71.54 
 
 		 264 aa  367  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1551  ABC transporter related protein  71.54 
 
 		 264 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.019793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  68.27 
 
 		 256 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  67.87 
 
 		 255 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  67.89 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  68.98 
 
 		 251 aa  361  7.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  66.27 
 
 		 251 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  70.24 
 
 		 249 aa  360  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  68.02 
 
 		 256 aa  358  4e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  69.01 
 
 		 242 aa  358  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  70.78 
 
 		 244 aa  357  7e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3286  ABC transporter related protein  73.25 
 
 		 280 aa  357  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00174942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3519  ABC transporter related  69.55 
 
 		 244 aa  352  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.221334 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  66.53 
 
 		 274 aa  345  3e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  66.53 
 
 		 242 aa  340  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22740  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  64.96 
 
 		 264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.547683  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  62.75 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  62.4 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.57 
 
 		 242 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  61.79 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 242 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  62.96 
 
 		 243 aa  313  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  59.27 
 
 		 252 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  60.64 
 
 		 253 aa  311  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 253 aa  310  1e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.45 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30090  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 		 252 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  62.45 
 
 		 252 aa  308  5e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  63.14 
 
 		 244 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  58.06 
 
 		 255 aa  307  9e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  60.74 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  60.17 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  61 
 
 		 244 aa  307  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  62.14 
 
 		 243 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  60.17 
 
 		 263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2175  ABC transporter related  59.59 
 
 		 260 aa  305  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.240046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  57.26 
 
 		 249 aa  305  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  60.66 
 
 		 253 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3597  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.42 
 
 		 260 aa  304  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345291  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  60 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  58.68 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2319  ABC transporter related  60.42 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  59.92 
 
 		 259 aa  303  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  58.73 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  59.5 
 
 		 241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  59.43 
 
 		 246 aa  303  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  61.13 
 
 		 252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  60.91 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  59.26 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.26 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  60.08 
 
 		 246 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2152  ABC transporter related  60 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  59.75 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  60.25 
 
 		 257 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  58.8 
 
 		 254 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  59.34 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  59.34 
 
 		 262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  59.04 
 
 		 256 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  60.57 
 
 		 253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.4 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  59.34 
 
 		 262 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 240 aa  301  8.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1428  ATPase  58.33 
 
 		 242 aa  300  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  59.59 
 
 		 245 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  60.25 
 
 		 257 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7087  ABC transporter related  59.51 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  60.17 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  59.34 
 
 		 251 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0862  ABC transporter related  58.37 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.94848 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  60.83 
 
 		 244 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  59.92 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  58.26 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  59.92 
 
 		 254 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1832  ABC transporter related  61.16 
 
 		 242 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0351546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2139  ABC transporter-related protein  60.4 
 
 		 251 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  60.16 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1622  ABC transporter related  57.83 
 
 		 252 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320946  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.75 
 
 		 244 aa  299  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1179  ABC transporter related  62.08 
 
 		 241 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0654977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  60 
 
 		 254 aa  298  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  59.5 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>